Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZD4Q76G19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms