Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms