Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms