Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms