Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO3Q6UWJ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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