Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA5Q6Q788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms