Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KANK3Q6NY19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms