Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC70Q6NSX1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms