Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC8Q6A555 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms