Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46CQ5VWP2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM46CQ5VWP2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms