Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms