Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF14Q5SWL7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms