Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A13Q5J8X5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms