Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms