Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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