Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SDR39U1-207ENST00000553937 217 ntTSL 37.09□□□□□ -1.274e-7■■□□□ 13.2
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SRSF7Q16629 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 56.12□□□□□ -1.434e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 26.06□□□□□ -1.444e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.444e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 25.4□□□□□ -1.544e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 CRLS1-206ENST00000489345 644 ntTSL 54.37□□□□□ -1.714e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.734e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 WWTR1-209ENST00000479238 697 ntTSL 315.46■□□□□ 0.071e-8■■□□□ 13.1
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SRSF7Q16629 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 13.1
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SRSF7Q16629 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 25.31□□□□□ -1.562e-6■■□□□ 12.9
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SRSF7Q16629 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.688e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.648e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.328e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-216ENST00000554228 2555 ntTSL 517.04■□□□□ 0.328e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.288e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 315.94■□□□□ 0.141e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.128e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-209ENST00000535194 710 ntTSL 314.67□□□□□ -0.068e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.078e-7■■□□□ 12.8
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SRSF7Q16629 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 314.2□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 12.8
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SRSF7Q16629 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.178e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 413.24□□□□□ -0.291e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 312.57□□□□□ -0.41e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 411.7□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 511.04□□□□□ -0.641e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 410.98□□□□□ -0.651e-7■■□□□ 12.8
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