Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms