Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TLR1Q15399 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLR1Q15399 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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