Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT31Q15323 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT31Q15323 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT31Q15323 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT31Q15323 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT31Q15323 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT31Q15323 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT31Q15323 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms