Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms