Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KARSQ15046 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KARSQ15046 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KARSQ15046 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KARSQ15046 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KARSQ15046 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KARSQ15046 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KARSQ15046 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KARSQ15046 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KARSQ15046 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KARSQ15046 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KARSQ15046 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KARSQ15046 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KARSQ15046 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KARSQ15046 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KARSQ15046 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KARSQ15046 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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