Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB39AQ14964 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms