Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IHHQ14623 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IHHQ14623 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IHHQ14623 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IHHQ14623 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IHHQ14623 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IHHQ14623 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IHHQ14623 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IHHQ14623 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IHHQ14623 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IHHQ14623 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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