Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
COL9A3Q14050 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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