Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H3Q13889 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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