Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3BQ13214 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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