Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNMA1Q12791 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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