Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4DQ08499 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms