Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX8Q06710 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms