Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNC4Q03721 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms