Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG1Q02413 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms