Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH6A1Q02252 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH6A1Q02252 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms