Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms