Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A3Q01959 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A3Q01959 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms