Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms