Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFITM3Q01628 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms