Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP1P63208 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKP1P63208 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKP1P63208 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP1P63208 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP1P63208 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP1P63208 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP1P63208 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP1P63208 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKP1P63208 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKP1P63208 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKP1P63208 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms