Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms