Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1P56182 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1P56182 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1P56182 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP1P56182 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP1P56182 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP1P56182 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP1P56182 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1P56182 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1P56182 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP1P56182 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP1P56182 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP1P56182 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP1P56182 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP1P56182 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP1P56182 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP1P56182 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP1P56182 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP1P56182 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms