Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms