Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUCLG1P53597 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms