Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR1P51861 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR1P51861 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR1P51861 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR1P51861 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR1P51861 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR1P51861 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR1P51861 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR1P51861 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR1P51861 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR1P51861 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR1P51861 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR1P51861 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR1P51861 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR1P51861 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR1P51861 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR1P51861 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR1P51861 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR1P51861 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR1P51861 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR1P51861 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR1P51861 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR1P51861 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms