Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLK1P49759 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLK1P49759 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLK1P49759 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLK1P49759 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLK1P49759 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLK1P49759 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLK1P49759 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLK1P49759 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLK1P49759 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLK1P49759 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLK1P49759 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLK1P49759 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLK1P49759 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLK1P49759 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLK1P49759 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLK1P49759 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLK1P49759 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLK1P49759 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms