Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARL1P40616 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARL1P40616 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL1P40616 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL1P40616 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL1P40616 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL1P40616 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL1P40616 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL1P40616 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARL1P40616 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARL1P40616 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL1P40616 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms