Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJC1P36383 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJC1P36383 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJC1P36383 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJC1P36383 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJC1P36383 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJC1P36383 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJC1P36383 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GJC1P36383 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJC1P36383 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJC1P36383 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJC1P36383 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJC1P36383 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJC1P36383 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms