Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCD1P33897 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms