Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A1P32418 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms