Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD6P30203 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CD6P30203 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD6P30203 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD6P30203 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD6P30203 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD6P30203 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD6P30203 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD6P30203 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD6P30203 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD6P30203 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD6P30203 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD6P30203 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD6P30203 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD6P30203 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD6P30203 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD6P30203 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD6P30203 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD6P30203 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD6P30203 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD6P30203 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD6P30203 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms