Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRMP28827 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
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