Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HTR2AP28223 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms